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一种观点认为，华科在招生人数远多于东南的情况下，全国有18个省比东南分数线高，东南只有8个左右的省分数线比华科高，要知道，南京武汉地域差不多，从这点就可以高下立判了；
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其次，华科27个两院院士，东南12个，杰青人数华科62个，东南42个，长江学者华科22个，东南13个，可以说华科的师资也远超东南；
还有学科评估，华科A+4个，其余A类10个，B+19个，东南A+5个，其余A类7个，B+9个。全球千分之一学科华科5个，东南2个。
东南根本比不过华科，当年华工就是四大工学院之首，更何况现在的华科还合并了同济医科大，就算是东南合并了南京医科大学，也差着同济医学院一个档次……
对此观点不敢苟同，要是比c类，华科恐怕比清北还要强些。985高校，要比就要比顶级学科数量。至于说分数，看看东南分数占优的是哪些省份？京浙粤沪，经济越发达，资讯越发达，越不相信华科的炒作。而且绝大多数高薪岗位都在这些地区，实际上，华科毕业的学生在国内也就去这些地方。
至于师资力量，华科所谓27个院士，其中包含了双聘院士。事实上，两校经费相当，东南人员少，老师人均预算多，东南的门槛更高高。至于论文，计算机esi刷到全球十几，在国内计算机，电子，通讯，自控都排不到前十。
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另外，四大工学院之首从来就是东南，十个一流工科，华科有什么？华科并了同济医学院在系科上并没有形成整体合力，反而互相争夺资源。就这点经费，投了同济医学院，工科就拉垮。反之投了工科，医学院就不行。
应当看到，现在对于国内高校的评价标准就是双一流体系。华科在东南面前完全不占优势。假如华科有十几个一流学科散布在文理工医，那是综合性大学。
假如用大把的二三流学科充数，那肯定不是国家所希望的综合性大学。以华科的规模，2021年人均预算只是985中下水平，这些钱还要用来维持一批比较差的学科和庞大的基建。
国家需要的是华科的机械，不需要一批与国无用的二三流学科。东南规模只有华科一半，但是预算与华科相当。东南转华科的所谓综合性模式非常容易，但是华科想走东南的专精路线已经不可能了。
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